MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 263

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187108	GATG	2	8	168	175	25 %	25 %	50 %	0 %	409251044
2	NT_187108	AAAT	2	8	610	617	75 %	25 %	0 %	0 %	409251045
3	NT_187108	AGCA	2	8	622	629	50 %	0 %	25 %	25 %	409251045
4	NT_187108	TGA	3	9	674	682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251045
5	NT_187108	TAA	2	6	1277	1282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251047
6	NT_187108	CAA	2	6	1573	1578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251048
7	NT_187108	ATCA	2	8	1600	1607	50 %	25 %	0 %	25 %	409251048
8	NT_187108	GATT	2	8	1609	1616	25 %	50 %	25 %	0 %	409251048
9	NT_187108	TGC	2	6	1639	1644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251048
10	NT_187108	AC	3	6	1650	1655	50 %	0 %	0 %	50 %	409251048
11	NT_187108	GGT	2	6	1673	1678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251048
12	NT_187108	TGC	2	6	1699	1704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251048
13	NT_187108	CTCC	2	8	1826	1833	0 %	25 %	0 %	75 %	409251048
14	NT_187108	ACCA	2	8	1889	1896	50 %	0 %	0 %	50 %	409251048
15	NT_187108	GCA	2	6	1949	1954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251048
16	NT_187108	GA	3	6	1982	1987	50 %	0 %	50 %	0 %	409251048
17	NT_187108	ATT	2	6	2005	2010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251048
18	NT_187108	GAT	2	6	2021	2026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251048
19	NT_187108	GGC	2	6	2080	2085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251048
20	NT_187108	TAG	2	6	2095	2100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251049
21	NT_187108	ATC	2	6	2117	2122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251049
22	NT_187108	A	6	6	2306	2311	100 %	0 %	0 %	0 %	409251049
23	NT_187108	ACA	2	6	2449	2454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251049
24	NT_187108	AGC	2	6	2455	2460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251049
25	NT_187108	CAG	2	6	2483	2488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251049
26	NT_187108	CAACA	2	10	2499	2508	60 %	0 %	0 %	40 %	409251049
27	NT_187108	TGA	3	9	2530	2538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251049
28	NT_187108	GAA	2	6	2698	2703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251050
29	NT_187108	TCA	2	6	2740	2745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251050
30	NT_187108	TGG	2	6	2785	2790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251050
31	NT_187108	CAT	2	6	2924	2929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251050
32	NT_187108	TG	3	6	2935	2940	0 %	50 %	50 %	0 %	409251050
33	NT_187108	GTG	2	6	2988	2993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251050
34	NT_187108	TCG	2	6	3017	3022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251050
35	NT_187108	TGA	2	6	3093	3098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251050
36	NT_187108	AAT	2	6	3149	3154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251050
37	NT_187108	TATG	2	8	3180	3187	25 %	50 %	25 %	0 %	409251051
38	NT_187108	CGC	2	6	3202	3207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251051
39	NT_187108	A	6	6	3249	3254	100 %	0 %	0 %	0 %	409251051
40	NT_187108	AGAA	2	8	3329	3336	75 %	0 %	25 %	0 %	409251051
41	NT_187108	CATC	2	8	3359	3366	25 %	25 %	0 %	50 %	409251051
42	NT_187108	AAG	2	6	3644	3649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251052
43	NT_187108	CAC	2	6	3683	3688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251052
44	NT_187108	GGA	2	6	3747	3752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409251052
45	NT_187108	GCG	2	6	3760	3765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251052
46	NT_187108	ATTT	2	8	3773	3780	25 %	75 %	0 %	0 %	409251052
47	NT_187108	TGTGA	2	10	3781	3790	20 %	40 %	40 %	0 %	409251052
48	NT_187108	ATTTC	2	10	3818	3827	20 %	60 %	0 %	20 %	409251052
49	NT_187108	TGA	2	6	4002	4007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251052
50	NT_187108	CAA	2	6	4032	4037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251052
51	NT_187108	ATG	2	6	4046	4051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251052
52	NT_187108	GGA	2	6	4117	4122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409251052
53	NT_187108	GGCT	2	8	4212	4219	0 %	25 %	50 %	25 %	409251052
54	NT_187108	ATT	2	6	4266	4271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251052
55	NT_187108	ACG	2	6	4351	4356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251053
56	NT_187108	CGA	2	6	4363	4368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251053
57	NT_187108	GCG	2	6	4384	4389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251053
58	NT_187108	GAT	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251053
59	NT_187108	ACA	2	6	4454	4459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251053
60	NT_187108	GCT	2	6	4463	4468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251053
61	NT_187108	AGCAA	2	10	4473	4482	60 %	0 %	20 %	20 %	409251053
62	NT_187108	TC	3	6	4510	4515	0 %	50 %	0 %	50 %	409251053
63	NT_187108	TGA	2	6	4604	4609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251053
64	NT_187108	CGC	2	6	4619	4624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251053
65	NT_187108	GCT	2	6	4640	4645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251053
66	NT_187108	GAT	2	6	4719	4724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251053
67	NT_187108	AAG	2	6	4731	4736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251053
68	NT_187108	CGC	2	6	4892	4897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251053
69	NT_187108	A	6	6	4934	4939	100 %	0 %	0 %	0 %	409251054
70	NT_187108	GGC	2	6	4967	4972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251054
71	NT_187108	TG	3	6	4991	4996	0 %	50 %	50 %	0 %	409251054
72	NT_187108	TGC	2	6	5037	5042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251054
73	NT_187108	GCT	2	6	5066	5071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251054
74	NT_187108	CAT	2	6	5337	5342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251054
75	NT_187108	ATT	2	6	5592	5597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251055
76	NT_187108	GT	3	6	5711	5716	0 %	50 %	50 %	0 %	409251055
77	NT_187108	AGC	2	6	5729	5734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251055
78	NT_187108	GAT	2	6	5749	5754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251055
79	NT_187108	TA	3	6	5764	5769	50 %	50 %	0 %	0 %	409251055
80	NT_187108	CAGC	2	8	5785	5792	25 %	0 %	25 %	50 %	409251055
81	NT_187108	TGA	2	6	5823	5828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251055
82	NT_187108	CA	3	6	5969	5974	50 %	0 %	0 %	50 %	409251056
83	NT_187108	CTC	2	6	6097	6102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409251056
84	NT_187108	GGT	2	6	6125	6130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251056
85	NT_187108	TTGC	2	8	6213	6220	0 %	50 %	25 %	25 %	409251056
86	NT_187108	GTG	2	6	6318	6323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251056
87	NT_187108	CCGC	2	8	6324	6331	0 %	0 %	25 %	75 %	409251056
88	NT_187108	TGC	2	6	6396	6401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251056
89	NT_187108	TGC	2	6	6404	6409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251056
90	NT_187108	GCCGC	2	10	6427	6436	0 %	0 %	40 %	60 %	409251056
91	NT_187108	GAT	2	6	6522	6527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251056
92	NT_187108	GCA	3	9	6630	6638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251056
93	NT_187108	CAG	2	6	6642	6647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251056
94	NT_187108	ATG	2	6	6656	6661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251056
95	NT_187108	TTA	3	9	7704	7712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251057
96	NT_187108	CCA	2	6	7731	7736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251057
97	NT_187108	CTT	2	6	7789	7794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251057
98	NT_187108	TAATA	2	10	7840	7849	60 %	40 %	0 %	0 %	409251057
99	NT_187108	ATA	2	6	7871	7876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251057
100	NT_187108	T	6	6	7891	7896	0 %	100 %	0 %	0 %	409251057
101	NT_187108	CGCC	2	8	8158	8165	0 %	0 %	25 %	75 %	409251057
102	NT_187108	AACC	2	8	8187	8194	50 %	0 %	0 %	50 %	409251057
103	NT_187108	CCAG	2	8	8261	8268	25 %	0 %	25 %	50 %	409251057
104	NT_187108	GCT	2	6	8269	8274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251057
105	NT_187108	T	6	6	8400	8405	0 %	100 %	0 %	0 %	409251057
106	NT_187108	TCCAG	2	10	8410	8419	20 %	20 %	20 %	40 %	409251057
107	NT_187108	GA	3	6	8515	8520	50 %	0 %	50 %	0 %	409251057
108	NT_187108	AATA	2	8	8528	8535	75 %	25 %	0 %	0 %	409251057
109	NT_187108	ATC	2	6	8574	8579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251057
110	NT_187108	T	6	6	8597	8602	0 %	100 %	0 %	0 %	409251057
111	NT_187108	TGA	2	6	8643	8648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251058
112	NT_187108	TCG	2	6	8667	8672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251058
113	NT_187108	TTA	2	6	8686	8691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251058
114	NT_187108	T	6	6	8906	8911	0 %	100 %	0 %	0 %	409251059
115	NT_187108	T	6	6	8927	8932	0 %	100 %	0 %	0 %	409251059
116	NT_187108	TGA	2	6	8976	8981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251059
117	NT_187108	TAA	2	6	8998	9003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251059
118	NT_187108	GAA	2	6	9052	9057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251059
119	NT_187108	GCA	2	6	9088	9093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251059
120	NT_187108	ATT	2	6	9159	9164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251059
121	NT_187108	GAT	2	6	9199	9204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251059
122	NT_187108	GCAG	2	8	9211	9218	25 %	0 %	50 %	25 %	409251059
123	NT_187108	ATC	2	6	9254	9259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251059
124	NT_187108	AGT	2	6	9307	9312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251059
125	NT_187108	GCC	2	6	9339	9344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251059
126	NT_187108	CCA	2	6	9349	9354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251059
127	NT_187108	CCA	2	6	9373	9378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251059
128	NT_187108	TGC	2	6	9423	9428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251059
129	NT_187108	CCT	2	6	9471	9476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409251059
130	NT_187108	GTT	2	6	9646	9651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251059
131	NT_187108	CTG	2	6	9713	9718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251059
132	NT_187108	GCC	2	6	9727	9732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251059
133	NT_187108	GACC	2	8	9740	9747	25 %	0 %	25 %	50 %	409251059
134	NT_187108	TGA	2	6	9903	9908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251059
135	NT_187108	AC	3	6	9947	9952	50 %	0 %	0 %	50 %	409251059
136	NT_187108	CACG	2	8	10021	10028	25 %	0 %	25 %	50 %	409251059
137	NT_187108	GCCT	2	8	10034	10041	0 %	25 %	25 %	50 %	409251059
138	NT_187108	TCA	3	9	10080	10088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251059
139	NT_187108	TCA	2	6	10107	10112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251059
140	NT_187108	CAT	2	6	10118	10123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251059
141	NT_187108	GCA	2	6	10145	10150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251060
142	NT_187108	TGG	2	6	10259	10264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251060
143	NT_187108	GCCA	2	8	10301	10308	25 %	0 %	25 %	50 %	409251060
144	NT_187108	CGC	2	6	10371	10376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251060
145	NT_187108	CTG	2	6	10425	10430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251060
146	NT_187108	CGC	2	6	10445	10450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251060
147	NT_187108	TGG	2	6	10498	10503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251060
148	NT_187108	TAA	2	6	10512	10517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251060
149	NT_187108	GCC	2	6	10525	10530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251060
150	NT_187108	CGG	2	6	10582	10587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251060
151	NT_187108	CG	3	6	10689	10694	0 %	0 %	50 %	50 %	409251060
152	NT_187108	TAAA	2	8	10703	10710	75 %	25 %	0 %	0 %	409251060
153	NT_187108	GC	3	6	10816	10821	0 %	0 %	50 %	50 %	409251060
154	NT_187108	CTGC	2	8	10866	10873	0 %	25 %	25 %	50 %	409251060
155	NT_187108	AGTCG	2	10	10953	10962	20 %	20 %	40 %	20 %	409251060
156	NT_187108	CAG	2	6	11058	11063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251060
157	NT_187108	CGC	2	6	11096	11101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251060
158	NT_187108	TTGA	2	8	11127	11134	25 %	50 %	25 %	0 %	409251060
159	NT_187108	ACT	2	6	11154	11159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251060
160	NT_187108	AGC	2	6	11176	11181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251060
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162	NT_187108	T	6	6	11278	11283	0 %	100 %	0 %	0 %	409251060
163	NT_187108	CCG	2	6	11369	11374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251060
164	NT_187108	T	8	8	11375	11382	0 %	100 %	0 %	0 %	409251060
165	NT_187108	ATT	2	6	11427	11432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251060
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168	NT_187108	CTG	3	9	11508	11516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251060
169	NT_187108	CG	3	6	11531	11536	0 %	0 %	50 %	50 %	409251060
170	NT_187108	CTG	2	6	11598	11603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251060
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174	NT_187108	CTGA	2	8	11799	11806	25 %	25 %	25 %	25 %	409251060
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176	NT_187108	CGTA	2	8	11841	11848	25 %	25 %	25 %	25 %	409251060
177	NT_187108	CGT	2	6	11862	11867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251060
178	NT_187108	A	6	6	11929	11934	100 %	0 %	0 %	0 %	409251060
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183	NT_187108	TAT	2	6	12205	12210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251061
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196	NT_187108	AGCG	2	8	12944	12951	25 %	0 %	50 %	25 %	409251061
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199	NT_187108	GC	3	6	13045	13050	0 %	0 %	50 %	50 %	409251061
200	NT_187108	CGC	2	6	13307	13312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251061
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230	NT_187108	CGG	2	6	14989	14994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251063
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240	NT_187108	TAAA	2	8	15483	15490	75 %	25 %	0 %	0 %	409251064
241	NT_187108	AGA	2	6	15522	15527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251064
242	NT_187108	ATC	2	6	15610	15615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251064
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244	NT_187108	AAT	2	6	15799	15804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251065
245	NT_187108	GAA	2	6	15826	15831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251065
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247	NT_187108	TGG	2	6	15878	15883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251065
248	NT_187108	CG	3	6	16160	16165	0 %	0 %	50 %	50 %	409251066
249	NT_187108	TGGCGT	2	12	16198	16209	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	409251066
250	NT_187108	GC	3	6	16277	16282	0 %	0 %	50 %	50 %	409251066
251	NT_187108	GAA	2	6	16352	16357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251066
252	NT_187108	CT	3	6	16387	16392	0 %	50 %	0 %	50 %	409251066
253	NT_187108	GCT	2	6	16402	16407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251066
254	NT_187108	GAT	2	6	16579	16584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251066
255	NT_187108	CG	3	6	16632	16637	0 %	0 %	50 %	50 %	409251066
256	NT_187108	GAT	2	6	16660	16665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251066
257	NT_187108	GC	3	6	16695	16700	0 %	0 %	50 %	50 %	409251066
258	NT_187108	A	7	7	16702	16708	100 %	0 %	0 %	0 %	409251066
259	NT_187108	GTTTG	2	10	16718	16727	0 %	60 %	40 %	0 %	409251066
260	NT_187108	CCA	3	9	16794	16802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251066
261	NT_187108	GCC	2	6	16835	16840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251066
262	NT_187108	ATT	2	6	16958	16963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251066
263	NT_187108	GC	3	6	16978	16983	0 %	0 %	50 %	50 %	409251066

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.